Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCF12Q99081 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCF12Q99081 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms