Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNB3P54284 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms