Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN7

ACER3, Alkaline ceramidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3Q9NUN7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACER3Q9NUN7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACER3Q9NUN7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACER3Q9NUN7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACER3Q9NUN7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACER3Q9NUN7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACER3Q9NUN7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACER3Q9NUN7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACER3Q9NUN7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACER3Q9NUN7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACER3Q9NUN7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACER3Q9NUN7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACER3Q9NUN7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACER3Q9NUN7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACER3Q9NUN7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACER3Q9NUN7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACER3Q9NUN7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACER3Q9NUN7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACER3Q9NUN7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACER3Q9NUN7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACER3Q9NUN7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACER3Q9NUN7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACER3Q9NUN7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACER3Q9NUN7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACER3Q9NUN7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACER3Q9NUN7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACER3Q9NUN7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACER3Q9NUN7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACER3Q9NUN7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACER3Q9NUN7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms