Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.33■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GIPC3Q8TF64 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms