Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA70

FAM47B, Protein FAM47B, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47BQ8NA70 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM47BQ8NA70 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM47BQ8NA70 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM47BQ8NA70 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM47BQ8NA70 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM47BQ8NA70 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM47BQ8NA70 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM47BQ8NA70 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM47BQ8NA70 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM47BQ8NA70 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM47BQ8NA70 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM47BQ8NA70 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM47BQ8NA70 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM47BQ8NA70 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM47BQ8NA70 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM47BQ8NA70 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM47BQ8NA70 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM47BQ8NA70 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM47BQ8NA70 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM47BQ8NA70 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47BQ8NA70 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47BQ8NA70 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47BQ8NA70 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47BQ8NA70 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47BQ8NA70 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47BQ8NA70 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47BQ8NA70 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47BQ8NA70 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47BQ8NA70 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47BQ8NA70 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47BQ8NA70 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47BQ8NA70 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47BQ8NA70 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47BQ8NA70 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47BQ8NA70 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47BQ8NA70 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47BQ8NA70 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47BQ8NA70 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47BQ8NA70 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47BQ8NA70 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM47BQ8NA70 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM47BQ8NA70 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM47BQ8NA70 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms