Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SYT9Q86SS6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SYT9Q86SS6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms