Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BROXQ5VW32 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BROXQ5VW32 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BROXQ5VW32 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms