Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -02e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 EEF1D-247ENST00000533204 842 ntTSL 214.31□□□□□ -0.122e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 EEF1D-236ENST00000531218 787 ntTSL 314.22□□□□□ -0.132e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 EEF1D-234ENST00000530616 749 ntTSL 314.01□□□□□ -0.172e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 EEF1D-253ENST00000534380 1001 ntTSL 514.01□□□□□ -0.172e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 EEF1D-248ENST00000533494 758 ntTSL 513.6□□□□□ -0.232e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 EEF1D-226ENST00000529516 473 ntTSL 310.43□□□□□ -0.742e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 CDC37-207ENST00000589755 793 ntTSL 220.21■□□□□ 0.832e-10■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 MICALL2-211ENST00000487156 874 ntTSL 520.4■□□□□ 0.868e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 MICALL2-204ENST00000467394 2080 ntTSL 219.05■□□□□ 0.648e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.433e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 TMC6-222ENST00000592076 693 ntTSL 316.76■□□□□ 0.273e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.872e-6■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 SSU72-204ENST00000378726 2238 ntTSL 218.18■□□□□ 0.52e-6■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.351e-6■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 RBM25-203ENST00000525321 2470 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.831e-6■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 EIF3D-211ENST00000478547 452 ntTSL 37.64□□□□□ -1.193e-13■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 CWC15-205ENST00000616442 559 ntTSL 24.63□□□□□ -1.672e-8■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.22e-9■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 02e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.422e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 CAST-206ENST00000395812 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.452e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 CAST-233ENST00000510756 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.592e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 CAST-230ENST00000510156 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.84□□□□□ -0.992e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 CAST-213ENST00000504465 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.032e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 CAST-204ENST00000341926 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.092e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 CAST-236ENST00000511782 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.152e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 CAST-205ENST00000348386 2272 ntTSL 1 (best)7.22□□□□□ -1.252e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 CAST-234ENST00000511049 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.262e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 CAST-228ENST00000509903 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.282e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.382e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.632e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.692e-7■■■□□ 16.5
PUM1Q14671 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.31e-7■■■□□ 16.4
PUM1Q14671 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.821e-7■■■□□ 16.4
PUM1Q14671 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.321e-7■■■□□ 16.4
PUM1Q14671 TOP1MT-213ENST00000521193 1960 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.481e-7■■■□□ 16.4
PUM1Q14671 TNNT1-215ENST00000592920 583 ntTSL 513.97□□□□□ -0.177e-9■■■□□ 16.4
PUM1Q14671 TNNT1-210ENST00000588147 489 ntTSL 1 (best)13.95□□□□□ -0.187e-9■■■□□ 16.4
PUM1Q14671 TNNT1-213ENST00000589226 604 ntTSL 213.69□□□□□ -0.227e-9■■■□□ 16.4
PUM1Q14671 MBD3-208ENST00000590830 1035 ntTSL 1 (best)22.89■■□□□ 1.252e-6■■■□□ 16.4
PUM1Q14671 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.22e-6■■■□□ 16.4
PUM1Q14671 MBD3-205ENST00000589064 1475 ntTSL 221.53■■□□□ 1.042e-6■■■□□ 16.4
PUM1Q14671 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.922e-6■■■□□ 16.4
PUM1Q14671 MBD3-209ENST00000592012 2379 ntTSL 518.69■□□□□ 0.582e-6■■■□□ 16.4
PUM1Q14671 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.522e-6■■■□□ 16.4
PUM1Q14671 MBD3-210ENST00000592361 907 ntTSL 518.25■□□□□ 0.512e-6■■■□□ 16.4
PUM1Q14671 MBD3-204ENST00000585967 583 ntTSL 418.25■□□□□ 0.512e-6■■■□□ 16.4
PUM1Q14671 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.512e-6■■■□□ 16.4
PUM1Q14671 MBD3-203ENST00000585903 415 ntTSL 511.53□□□□□ -0.562e-6■■■□□ 16.4
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PUM1Q14671 TNNT1-216ENST00000593046 800 ntTSL 214.65□□□□□ -0.064e-9■■■□□ 16.4
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PUM1Q14671 HAT1-203ENST00000412731 1567 ntTSL 1 (best)8.11□□□□□ -1.112e-8■■■□□ 16.4
PUM1Q14671 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.352e-8■■■□□ 16.4
PUM1Q14671 GOLGB1-208ENST00000494517 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)5.01□□□□□ -1.614e-10■■■□□ 16.3
PUM1Q14671 GOLGB1-206ENST00000489400 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 24.18□□□□□ -1.744e-10■■■□□ 16.3
PUM1Q14671 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.152e-6■■■□□ 16.3
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PUM1Q14671 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.751e-6■■■□□ 16.3
PUM1Q14671 TXNL4A-202ENST00000355491 803 ntTSL 1 (best)23.15■■□□□ 1.31e-6■■■□□ 16.3
PUM1Q14671 TXNL4A-204ENST00000585769 988 ntTSL 221.6■■□□□ 1.051e-6■■■□□ 16.3
PUM1Q14671 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.981e-6■■■□□ 16.3
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PUM1Q14671 TXNL4A-206ENST00000586612 448 ntTSL 317.96■□□□□ 0.471e-6■■■□□ 16.3
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PUM1Q14671 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.271e-6■■■□□ 16.3
PUM1Q14671 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.352e-7■■■□□ 16.3
PUM1Q14671 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.23e-6■■■□□ 16.3
PUM1Q14671 IGF2BP2-204ENST00000457616 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.453e-6■■■□□ 16.3
PUM1Q14671 IGF2BP2-203ENST00000421047 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.453e-6■■■□□ 16.3
PUM1Q14671 IGF2BP2-201ENST00000346192 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.543e-6■■■□□ 16.3
PUM1Q14671 HNRNPK-206ENST00000457156 1283 ntTSL 519.26■□□□□ 0.677e-8■■■□□ 16.3
PUM1Q14671 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.327e-8■■■□□ 16.3
PUM1Q14671 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.047e-8■■■□□ 16.3
PUM1Q14671 HNRNPK-205ENST00000376281 2928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.087e-8■■■□□ 16.3
PUM1Q14671 HNRNPK-201ENST00000351839 2652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.157e-8■■■□□ 16.3
PUM1Q14671 NAP1L1-212ENST00000547993 2481 ntTSL 1 (best)6.45□□□□□ -1.383e-31■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 SLTM-206ENST00000480144 2277 ntTSL 212.64□□□□□ -0.392e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 SLTM-226ENST00000628684 1040 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.942e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 SLTM-217ENST00000558756 896 ntTSL 56.46□□□□□ -1.382e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 SLTM-219ENST00000559305 559 ntTSL 46.24□□□□□ -1.412e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 SLTM-201ENST00000249736 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 55.78□□□□□ -1.482e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 RALY-206ENST00000448364 1204 ntTSL 225.36■■□□□ 1.654e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.474e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.474e-13■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.424e-10■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 MIB2-212ENST00000486072 568 ntTSL 322.94■■□□□ 1.264e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 VEGFA-217ENST00000518538 535 ntTSL 222.07■■□□□ 1.124e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.014e-10■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 14e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 GRK6-204ENST00000502598 557 ntTSL 421.29■■□□□ 14e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 SLMAP-218ENST00000481846 556 ntTSL 421.14■□□□□ 0.974e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 PHPT1-205ENST00000492540 1316 ntTSL 1 (best)20.87■□□□□ 0.934e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 DDA1-202ENST00000593466 757 ntTSL 319.98■□□□□ 0.794e-10■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.784e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 DDA1-204ENST00000596582 502 ntTSL 319.55■□□□□ 0.724e-10■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.654e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.644e-7■■■□□ 16.2
PUM1Q14671 RPS6KB2-209ENST00000528964 1806 ntTSL 518.96■□□□□ 0.634e-7■■■□□ 16.2
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