Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTM1Q13496 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTM1Q13496 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTM1Q13496 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
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