Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS3AP61247 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPS3AP61247 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPS3AP61247 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPS3AP61247 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPS3AP61247 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS3AP61247 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS3AP61247 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS3AP61247 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS3AP61247 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS3AP61247 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS3AP61247 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS3AP61247 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS3AP61247 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS3AP61247 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS3AP61247 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS3AP61247 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS3AP61247 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS3AP61247 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RPS3AP61247 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS3AP61247 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RPS3AP61247 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS3AP61247 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS3AP61247 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS3AP61247 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS3AP61247 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS3AP61247 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS3AP61247 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS3AP61247 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS3AP61247 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS3AP61247 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS3AP61247 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS3AP61247 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS3AP61247 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS3AP61247 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS3AP61247 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS3AP61247 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS3AP61247 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS3AP61247 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS3AP61247 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS3AP61247 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS3AP61247 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS3AP61247 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS3AP61247 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS3AP61247 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RPS3AP61247 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS3AP61247 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS3AP61247 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPS3AP61247 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS3AP61247 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPS3AP61247 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS3AP61247 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPS3AP61247 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS3AP61247 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS3AP61247 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS3AP61247 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS3AP61247 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS3AP61247 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS3AP61247 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS3AP61247 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS3AP61247 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS3AP61247 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS3AP61247 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS3AP61247 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS3AP61247 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms