Protein–RNA interactions for Protein: P49720

PSMB3, Proteasome subunit beta type-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB3P49720 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB3P49720 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMB3P49720 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMB3P49720 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms