Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 TTLL3-225ENST00000473661 3811 ntTSL 510.88□□□□□ -0.671e-12■■■■■ 40
GTF2F1P35269 TTLL3-226ENST00000474948 603 ntTSL 410.71□□□□□ -0.691e-12■■■■■ 40
GTF2F1P35269 TTLL3-228ENST00000483051 4176 ntTSL 510.68□□□□□ -0.71e-12■■■■■ 40
GTF2F1P35269 TTLL3-220ENST00000452823 579 ntTSL 39.34□□□□□ -0.911e-12■■■■■ 40
GTF2F1P35269 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.071e-8■■■■■ 40
GTF2F1P35269 ZNF444-202ENST00000586123 574 ntTSL 426.92■■□□□ 1.92e-7■■■■■ 39.9
GTF2F1P35269 ZNF444-205ENST00000587467 646 ntTSL 225.21■■□□□ 1.632e-7■■■■■ 39.9
GTF2F1P35269 ZNF444-208ENST00000588358 642 ntTSL 225.2■■□□□ 1.622e-7■■■■■ 39.9
GTF2F1P35269 ZNF444-203ENST00000587195 571 ntTSL 425.2■■□□□ 1.622e-7■■■■■ 39.9
GTF2F1P35269 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.123e-7■■■■■ 39.9
GTF2F1P35269 STXBP2-208ENST00000595800 1974 ntTSL 222.51■■□□□ 1.195e-11■■■■■ 39.8
GTF2F1P35269 STXBP2-205ENST00000593854 704 ntTSL 220.54■□□□□ 0.885e-11■■■■■ 39.8
GTF2F1P35269 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.513e-7■■■■■ 39.8
GTF2F1P35269 ATP11A-209ENST00000466946 431 ntTSL 57.73□□□□□ -1.177e-7■■■■■ 39.8
GTF2F1P35269 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.347e-7■■■■■ 39.8
GTF2F1P35269 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.67■□□□□ 0.91e-18■■■■■ 39.8
GTF2F1P35269 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.751e-18■■■■■ 39.8
GTF2F1P35269 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.631e-18■■■■■ 39.8
GTF2F1P35269 MAD1L1-215ENST00000464742 449 ntTSL 517.38■□□□□ 0.374e-9■■■■■ 39.8
GTF2F1P35269 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.241e-18■■■■■ 39.8
GTF2F1P35269 MAD1L1-222ENST00000491858 494 ntTSL 414.73□□□□□ -0.054e-9■■■■■ 39.8
GTF2F1P35269 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.485e-7■■■■■ 39.8
GTF2F1P35269 SRRM2-210ENST00000572721 841 ntTSL 215.73■□□□□ 0.112e-13■■■■■ 39.8
GTF2F1P35269 SRRM2-211ENST00000572883 887 ntTSL 211.4□□□□□ -0.582e-13■■■■■ 39.8
GTF2F1P35269 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.641e-8■■■■■ 39.8
GTF2F1P35269 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.161e-8■■■■■ 39.8
GTF2F1P35269 LINC01089-201ENST00000428029 1024 ntTSL 220.84■□□□□ 0.931e-8■■■■■ 39.8
GTF2F1P35269 LINC01089-210ENST00000543167 1059 ntTSL 219.88■□□□□ 0.771e-8■■■■■ 39.8
GTF2F1P35269 RHOF-206ENST00000545544 826 ntTSL 518.17■□□□□ 0.51e-8■■■■■ 39.8
GTF2F1P35269 RHOF-205ENST00000541657 1626 ntTSL 518.09■□□□□ 0.491e-8■■■■■ 39.8
GTF2F1P35269 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.481e-8■■■■■ 39.8
GTF2F1P35269 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.271e-8■■■■■ 39.8
GTF2F1P35269 LINC01089-208ENST00000541694 875 ntTSL 215.86■□□□□ 0.131e-8■■■■■ 39.8
GTF2F1P35269 LINC01089-204ENST00000535643 1014 ntTSL 1 (best)14□□□□□ -0.171e-8■■■■■ 39.8
GTF2F1P35269 LINC01089-205ENST00000536662 560 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.191e-8■■■■■ 39.8
GTF2F1P35269 LINC01089-212ENST00000545885 559 ntTSL 211.24□□□□□ -0.611e-8■■■■■ 39.8
GTF2F1P35269 CTBP1-205ENST00000504092 920 ntTSL 521.44■■□□□ 1.026e-7■■■■■ 39.7
GTF2F1P35269 TMEM63A-201ENST00000366835 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.392e-7■■■■■ 39.7
GTF2F1P35269 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC14.96□□□□□ -0.015e-7■■■■■ 39.6
GTF2F1P35269 PTPRVP-201ENST00000482597 3999 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.665e-7■■■■■ 39.6
GTF2F1P35269 ANKMY1-221ENST00000480230 4640 ntTSL 213.87□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 39.6
GTF2F1P35269 TSPAN32-203ENST00000381117 798 ntTSL 1 (best)21.41■■□□□ 1.026e-7■■■■■ 39.6
GTF2F1P35269 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.466e-7■■■■■ 39.6
GTF2F1P35269 TSPAN32-202ENST00000339046 1202 ntTSL 217.95■□□□□ 0.466e-7■■■■■ 39.6
GTF2F1P35269 TSPAN32-212ENST00000484523 582 ntTSL 515.3■□□□□ 0.046e-7■■■■■ 39.6
GTF2F1P35269 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.155e-11■■■■■ 39.6
GTF2F1P35269 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.84e-7■■■■■ 39.6
GTF2F1P35269 ABCA7-217ENST00000533574 587 ntTSL 418.45■□□□□ 0.542e-9■■■■■ 39.6
GTF2F1P35269 PDXK-215ENST00000476313 1704 ntTSL 321.22■□□□□ 0.995e-9■■■■■ 39.6
GTF2F1P35269 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.975e-9■■■■■ 39.6
GTF2F1P35269 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.565e-9■■■■■ 39.6
GTF2F1P35269 SERGEF-212ENST00000529728 1396 ntTSL 527.58■■■□□ 2.014e-7■■■■■ 39.6
GTF2F1P35269 SERGEF-214ENST00000530925 793 ntTSL 325.15■■□□□ 1.624e-7■■■■■ 39.6
GTF2F1P35269 SERGEF-213ENST00000530613 893 ntTSL 524.84■■□□□ 1.574e-7■■■■■ 39.6
GTF2F1P35269 SERGEF-220ENST00000532389 833 ntTSL 523.47■■□□□ 1.354e-7■■■■■ 39.6
GTF2F1P35269 SERGEF-223ENST00000533328 541 ntTSL 523.11■■□□□ 1.294e-7■■■■■ 39.6
GTF2F1P35269 SERGEF-218ENST00000532212 622 ntTSL 323.11■■□□□ 1.294e-7■■■■■ 39.6
GTF2F1P35269 SERGEF-203ENST00000524716 548 ntTSL 410.31□□□□□ -0.764e-7■■■■■ 39.6
GTF2F1P35269 AC055860.1-201ENST00000525523 688 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.014e-7■■■■■ 39.6
GTF2F1P35269 TSPAN32-214ENST00000493924 1573 ntTSL 521.8■■□□□ 1.085e-7■■■■■ 39.5
GTF2F1P35269 TSPAN32-210ENST00000483227 886 ntTSL 1 (best)21.8■■□□□ 1.085e-7■■■■■ 39.5
GTF2F1P35269 TSPAN32-209ENST00000479508 741 ntTSL 221.41■■□□□ 1.025e-7■■■■■ 39.5
GTF2F1P35269 TSPAN32-216ENST00000498313 988 ntTSL 520.68■□□□□ 0.95e-7■■■■■ 39.5
GTF2F1P35269 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.675e-7■■■■■ 39.5
GTF2F1P35269 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.675e-7■■■■■ 39.5
GTF2F1P35269 TSPAN32-206ENST00000446063 1262 ntTSL 1 (best)18.09■□□□□ 0.495e-7■■■■■ 39.5
GTF2F1P35269 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.35e-7■■■■■ 39.5
GTF2F1P35269 TSPAN32-208ENST00000461200 3325 ntTSL 216.55■□□□□ 0.245e-7■■■■■ 39.5
GTF2F1P35269 TECR-209ENST00000596953 1043 ntTSL 224.44■■□□□ 1.51e-7■■■■■ 39.5
GTF2F1P35269 TECR-202ENST00000593637 1043 ntTSL 324.44■■□□□ 1.51e-7■■■■■ 39.5
GTF2F1P35269 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.61e-7■■■■■ 39.5
GTF2F1P35269 TECR-210ENST00000597607 1164 ntTSL 318.81■□□□□ 0.61e-7■■■■■ 39.5
GTF2F1P35269 TECR-216ENST00000598987 1202 ntTSL 217.1■□□□□ 0.331e-7■■■■■ 39.5
GTF2F1P35269 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.331e-7■■■■■ 39.5
GTF2F1P35269 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.331e-7■■■■■ 39.5
GTF2F1P35269 TECR-225ENST00000601652 551 ntTSL 415.64■□□□□ 0.091e-7■■■■■ 39.5
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GTF2F1P35269 TECR-205ENST00000594807 569 ntTSL 413.73□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 39.5
GTF2F1P35269 TECR-219ENST00000600076 484 ntTSL 310.89□□□□□ -0.671e-7■■■■■ 39.5
GTF2F1P35269 TECR-212ENST00000598333 822 ntTSL 310.57□□□□□ -0.721e-7■■■■■ 39.5
GTF2F1P35269 TECR-208ENST00000596164 245 ntTSL 38.66□□□□□ -1.021e-7■■■■■ 39.5
GTF2F1P35269 CSNK1D-221ENST00000582844 957 ntTSL 523.87■■□□□ 1.411e-7■■■■■ 39.5
GTF2F1P35269 CSNK1D-207ENST00000578194 567 ntTSL 413.73□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 39.5
GTF2F1P35269 PLEC-215ENST00000532346 316 ntTSL 317.2■□□□□ 0.348e-7■■■■■ 39.5
GTF2F1P35269 TRPM7-207ENST00000560955 7218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.714e-8■■■■■ 39.5
GTF2F1P35269 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.264e-8■■■■■ 39.5
GTF2F1P35269 TRPM7-205ENST00000560638 2518 ntTSL 1 (best)3.22□□□□□ -1.894e-8■■■■■ 39.5
GTF2F1P35269 OPLAH-201ENST00000527993 635 ntTSL 524.37■■□□□ 1.497e-8■■■■■ 39.5
GTF2F1P35269 OPLAH-202ENST00000531027 500 ntTSL 215.85■□□□□ 0.137e-8■■■■■ 39.5
GTF2F1P35269 SAMD4B-212ENST00000602243 672 ntTSL 328.56■■■□□ 2.166e-11■■■■■ 39.4
GTF2F1P35269 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.826e-11■■■■■ 39.4
GTF2F1P35269 SLC2A14-206ENST00000535344 561 ntTSL 420.47■□□□□ 0.876e-11■■■■■ 39.4
GTF2F1P35269 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.286e-11■■■■■ 39.4
GTF2F1P35269 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.316e-11■■■■■ 39.4
GTF2F1P35269 PITPNA-210ENST00000576722 793 ntTSL 330.74■■■□□ 2.511e-7■■■■■ 39.4
GTF2F1P35269 PITPNA-207ENST00000575288 1264 ntTSL 230.22■■■□□ 2.431e-7■■■■■ 39.4
GTF2F1P35269 PITPNA-211ENST00000576761 589 ntTSL 428.82■■■□□ 2.21e-7■■■■■ 39.4
GTF2F1P35269 PITPNA-209ENST00000576010 573 ntTSL 528.82■■■□□ 2.21e-7■■■■■ 39.4
GTF2F1P35269 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.831e-7■■■■■ 39.4
GTF2F1P35269 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.611e-7■■■■■ 39.4
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