RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576761.5

PITPNA-211, Transcript of phosphatidylinositol transfer protein alpha, human

TSL 4

Gene PITPNA, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PITPNA-211	ENST00000576761	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		63.91	■■■■■ 7.82
PITPNA-211	ENST00000576761	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		57.18	■■■■■ 6.74
PITPNA-211	ENST00000576761	ABCC9	O60706	1549 aa		56.57	■■■■■ 6.65
PITPNA-211	ENST00000576761	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		54.15	■■■■■ 6.26
PITPNA-211	ENST00000576761	NACAD	O15069	1562 aa		53.91	■■■■■ 6.22
PITPNA-211	ENST00000576761	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		53.67	■■■■■ 6.18
PITPNA-211	ENST00000576761	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		53.36	■■■■■ 6.13
PITPNA-211	ENST00000576761	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	53.08	■■■■■ 6.09
PITPNA-211	ENST00000576761	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		52.95	■■■■■ 6.07
PITPNA-211	ENST00000576761	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		52.86	■■■■■ 6.05
PITPNA-211	ENST00000576761	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	52.72	■■■■■ 6.03
PITPNA-211	ENST00000576761	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		52.53	■■■■■ 6
PITPNA-211	ENST00000576761	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		52.51	■■■■■ 6
PITPNA-211	ENST00000576761	SCRIB	Q14160	1630 aa		52.07	■■■■■ 5.93
PITPNA-211	ENST00000576761	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		51.92	■■■■■ 5.9
PITPNA-211	ENST00000576761	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	51.19	■■■■■ 5.79
PITPNA-211	ENST00000576761	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		51.16	■■■■■ 5.78
PITPNA-211	ENST00000576761	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		50.92	■■■■■ 5.74
PITPNA-211	ENST00000576761	SMARCA4	P51532	1647 aa		49.76	■■■■■ 5.56
PITPNA-211	ENST00000576761	NCAPD3	P42695	1498 aa		49.73	■■■■■ 5.55
PITPNA-211	ENST00000576761	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		49.64	■■■■■ 5.54
PITPNA-211	ENST00000576761	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	49.6	■■■■■ 5.53
PITPNA-211	ENST00000576761	SMARCA2	P51531	1590 aa		49.58	■■■■■ 5.53
PITPNA-211	ENST00000576761	HMGXB3	Q12766	1538 aa		49.44	■■■■■ 5.51
PITPNA-211	ENST00000576761	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		49.29	■■■■■ 5.48
PITPNA-211	ENST00000576761	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		49.22	■■■■■ 5.47
PITPNA-211	ENST00000576761	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	49.21	■■■■■ 5.47
PITPNA-211	ENST00000576761	ERCC6	Q03468	1493 aa		48.84	■■■■■ 5.41
PITPNA-211	ENST00000576761	NES	P48681	1621 aa		48.74	■■■■■ 5.39
PITPNA-211	ENST00000576761	WIZ	O95785	1651 aa		48.69	■■■■■ 5.39
PITPNA-211	ENST00000576761	CUX2	O14529	1486 aa		48.59	■■■■■ 5.37
PITPNA-211	ENST00000576761	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		48.56	■■■■■ 5.36
PITPNA-211	ENST00000576761	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	48.41	■■■■■ 5.34
PITPNA-211	ENST00000576761	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		48.24	■■■■■ 5.31
PITPNA-211	ENST00000576761	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		48.24	■■■■■ 5.31
PITPNA-211	ENST00000576761	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		48.21	■■■■■ 5.31
PITPNA-211	ENST00000576761	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	48.19	■■■■■ 5.31
PITPNA-211	ENST00000576761	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	48.12	■■■■■ 5.29
PITPNA-211	ENST00000576761	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		47.9	■■■■■ 5.26
PITPNA-211	ENST00000576761	CFTR	P13569	1480 aa		47.81	■■■■■ 5.24
PITPNA-211	ENST00000576761	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		47.78	■■■■■ 5.24
PITPNA-211	ENST00000576761	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		47.71	■■■■■ 5.23
PITPNA-211	ENST00000576761	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		47.7	■■■■■ 5.23
PITPNA-211	ENST00000576761	WDR62	O43379	1518 aa		47.66	■■■■■ 5.22
PITPNA-211	ENST00000576761	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		47.54	■■■■■ 5.2
PITPNA-211	ENST00000576761	PRDM2	Q13029	1718 aa		47.48	■■■■■ 5.19
PITPNA-211	ENST00000576761	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	47.25	■■■■■ 5.16
PITPNA-211	ENST00000576761	TOPBP1	Q92547	1522 aa		46.85	■■■■■ 5.09
PITPNA-211	ENST00000576761	ABCC8	Q09428	1581 aa		46.84	■■■■■ 5.09
PITPNA-211	ENST00000576761	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		46.75	■■■■■ 5.07
PITPNA-211	ENST00000576761	IFT140	Q96RY7	1462 aa		46.74	■■■■■ 5.07
PITPNA-211	ENST00000576761	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	46.64	■■■■■ 5.06
PITPNA-211	ENST00000576761	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	46.56	■■■■■ 5.04
PITPNA-211	ENST00000576761	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		46.43	■■■■■ 5.02
PITPNA-211	ENST00000576761	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	46.41	■■■■■ 5.02
PITPNA-211	ENST00000576761	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	46.4	■■■■■ 5.02
PITPNA-211	ENST00000576761	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	46.39	■■■■■ 5.02
PITPNA-211	ENST00000576761	CUX1	P39880	1505 aa		46.23	■■■■■ 4.99
PITPNA-211	ENST00000576761	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	46.21	■■■■■ 4.99
PITPNA-211	ENST00000576761	SOGA1	O94964	1423 aa		46.2	■■■■■ 4.99
PITPNA-211	ENST00000576761	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		46.2	■■■■■ 4.99
PITPNA-211	ENST00000576761	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		46.19	■■■■■ 4.99
PITPNA-211	ENST00000576761	WDR97	A6NE52	1622 aa		46.03	■■■■■ 4.96
PITPNA-211	ENST00000576761	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	46.01	■■■■■ 4.96
PITPNA-211	ENST00000576761	TRIM41	Q8WV44	630 aa		46.01	■■■■■ 4.96
PITPNA-211	ENST00000576761	CHD1	O14646	1710 aa		45.97	■■■■■ 4.95
PITPNA-211	ENST00000576761	FBLN2	P98095	1184 aa		45.81	■■■■■ 4.92
PITPNA-211	ENST00000576761	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		45.78	■■■■■ 4.92
PITPNA-211	ENST00000576761	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		45.78	■■■■■ 4.92
PITPNA-211	ENST00000576761	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		45.78	■■■■■ 4.92
PITPNA-211	ENST00000576761	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		45.78	■■■■■ 4.92
PITPNA-211	ENST00000576761	GRIN2B	Q13224	1484 aa		45.75	■■■■■ 4.91
PITPNA-211	ENST00000576761	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	45.72	■■■■■ 4.91
PITPNA-211	ENST00000576761	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		45.71	■■■■■ 4.91
PITPNA-211	ENST00000576761	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		45.69	■■■■■ 4.9
PITPNA-211	ENST00000576761	ARHGEF11	O15085	1522 aa		45.68	■■■■■ 4.9
PITPNA-211	ENST00000576761	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	45.68	■■■■■ 4.9	4e-6	■■■■□ 21.5
PITPNA-211	ENST00000576761	TOP2B	Q02880	1626 aa		45.67	■■■■■ 4.9
PITPNA-211	ENST00000576761	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		45.66	■■■■■ 4.9
PITPNA-211	ENST00000576761	PBRM1	Q86U86	1689 aa		45.66	■■■■■ 4.9
PITPNA-211	ENST00000576761	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		45.61	■■■■■ 4.89
PITPNA-211	ENST00000576761	SYNJ1	O43426	1573 aa		45.61	■■■■■ 4.89
PITPNA-211	ENST00000576761	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	45.58	■■■■■ 4.89
PITPNA-211	ENST00000576761	SYNJ2	O15056	1496 aa		45.55	■■■■■ 4.88
PITPNA-211	ENST00000576761	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		45.42	■■■■■ 4.86
PITPNA-211	ENST00000576761	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		45.28	■■■■■ 4.84
PITPNA-211	ENST00000576761	ARAP1	Q96P48	1450 aa		45.25	■■■■■ 4.83
PITPNA-211	ENST00000576761	ADAMTS12	P58397	1594 aa		45.21	■■■■■ 4.83
PITPNA-211	ENST00000576761	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		45.17	■■■■■ 4.82
PITPNA-211	ENST00000576761	GRIN2A	Q12879	1464 aa		45.17	■■■■■ 4.82
PITPNA-211	ENST00000576761	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		45.1	■■■■■ 4.81
PITPNA-211	ENST00000576761	NUP160	Q12769	1436 aa		44.98	■■■■■ 4.79
PITPNA-211	ENST00000576761	CEP170	Q5SW79	1584 aa		44.98	■■■■■ 4.79
PITPNA-211	ENST00000576761	KIF27	Q86VH2	1401 aa		44.78	■■■■■ 4.76
PITPNA-211	ENST00000576761	SHROOM2	Q13796	1616 aa		44.76	■■■■■ 4.76
PITPNA-211	ENST00000576761	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		44.71	■■■■■ 4.75
PITPNA-211	ENST00000576761	IGF1R	P08069	1367 aa		44.67	■■■■■ 4.74
PITPNA-211	ENST00000576761	CUL7	Q14999	1698 aa		44.65	■■■■■ 4.74
PITPNA-211	ENST00000576761	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	44.63	■■■■■ 4.74
PITPNA-211	ENST00000576761	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		44.57	■■■■■ 4.73

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