RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576722.5

PITPNA-210, Transcript of phosphatidylinositol transfer protein alpha, humanhuman

TSL 3

Gene PITPNA, Length 793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNA-210ENST00000576722 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.99■■■■■ 8.47
PITPNA-210ENST00000576722 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa60.64■■■■■ 7.3
PITPNA-210ENST00000576722 ABCC9O60706 1549 aa59.94■■■■■ 7.19
PITPNA-210ENST00000576722 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa57.38■■■■■ 6.78
PITPNA-210ENST00000576722 DCAF8L2P0C7V8 631 aa57.23■■■■■ 6.75
PITPNA-210ENST00000576722 NACADO15069 1562 aa57.16■■■■■ 6.74
PITPNA-210ENST00000576722 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.58■■■■■ 6.65
PITPNA-210ENST00000576722 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP56.5■■■■■ 6.63
PITPNA-210ENST00000576722 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa56.17■■■■■ 6.58
PITPNA-210ENST00000576722 UNC13AQ9UPW8 1703 aa56.06■■■■■ 6.56
PITPNA-210ENST00000576722 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.97■■■■■ 6.55
PITPNA-210ENST00000576722 BICRAQ9NZM4 1560 aa55.62■■■■■ 6.49
PITPNA-210ENST00000576722 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.48■■■■■ 6.47
PITPNA-210ENST00000576722 SCRIBQ14160 1630 aa55.37■■■■■ 6.45
PITPNA-210ENST00000576722 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.94■■■■■ 6.39
PITPNA-210ENST00000576722 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP54.22■■■■■ 6.27
PITPNA-210ENST00000576722 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.15■■■■■ 6.26
PITPNA-210ENST00000576722 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.9■■■■■ 6.22
PITPNA-210ENST00000576722 SMARCA4P51532 1647 aa52.88■■■■■ 6.05
PITPNA-210ENST00000576722 NCAPD3P42695 1498 aa52.75■■■■■ 6.03
PITPNA-210ENST00000576722 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.73■■■■■ 6.03
PITPNA-210ENST00000576722 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa52.71■■■■■ 6.03
PITPNA-210ENST00000576722 SMARCA2P51531 1590 aa52.63■■■■■ 6.02
PITPNA-210ENST00000576722 HMGXB3Q12766 1538 aa52.42■■■■■ 5.98
PITPNA-210ENST00000576722 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.41■■■■■ 5.98
PITPNA-210ENST00000576722 PEG3Q9GZU2 1588 aa52.3■■■■■ 5.96
PITPNA-210ENST00000576722 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP52.29■■■■■ 5.96
PITPNA-210ENST00000576722 WIZO95785 1651 aa51.84■■■■■ 5.89
PITPNA-210ENST00000576722 ERCC6Q03468 1493 aa51.72■■■■■ 5.87
PITPNA-210ENST00000576722 NESP48681 1621 aa51.7■■■■■ 5.87
PITPNA-210ENST00000576722 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.62■■■■■ 5.85
PITPNA-210ENST00000576722 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.45■■■■■ 5.83
PITPNA-210ENST00000576722 CUX2O14529 1486 aa51.28■■■■■ 5.8
PITPNA-210ENST00000576722 CADPSQ9ULU8 1353 aa51.22■■■■■ 5.79
PITPNA-210ENST00000576722 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.22■■■■■ 5.79
PITPNA-210ENST00000576722 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51.16■■■■■ 5.78
PITPNA-210ENST00000576722 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.06■■■■■ 5.76
PITPNA-210ENST00000576722 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.97■■■■■ 5.75
PITPNA-210ENST00000576722 CFTRP13569 1480 aa50.78■■■■■ 5.72
PITPNA-210ENST00000576722 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.65■■■■■ 5.7
PITPNA-210ENST00000576722 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.65■■■■■ 5.7
PITPNA-210ENST00000576722 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.65■■■■■ 5.7
PITPNA-210ENST00000576722 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.62■■■■■ 5.69
PITPNA-210ENST00000576722 WDR62O43379 1518 aa50.46■■■■■ 5.67
PITPNA-210ENST00000576722 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.37■■■■■ 5.65
PITPNA-210ENST00000576722 PRDM2Q13029 1718 aa50.34■■■■■ 5.65
PITPNA-210ENST00000576722 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP50.16■■■■■ 5.62
PITPNA-210ENST00000576722 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.08■■■■■ 5.61
PITPNA-210ENST00000576722 TOPBP1Q92547 1522 aa49.76■■■■■ 5.56
PITPNA-210ENST00000576722 ABCC8Q09428 1581 aa49.72■■■■■ 5.55
PITPNA-210ENST00000576722 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.65■■■■■ 5.54
PITPNA-210ENST00000576722 IFT140Q96RY7 1462 aa49.57■■■■■ 5.53
PITPNA-210ENST00000576722 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.42■■■■■ 5.5
PITPNA-210ENST00000576722 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP49.31■■■■■ 5.48
PITPNA-210ENST00000576722 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP49.23■■■■■ 5.47
PITPNA-210ENST00000576722 CUX1P39880 1505 aa49.19■■■■■ 5.47
PITPNA-210ENST00000576722 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP49.17■■■■■ 5.46
PITPNA-210ENST00000576722 OSCARQ8IYS5 282 aa49.16■■■■■ 5.46
PITPNA-210ENST00000576722 SOGA1O94964 1423 aa49.14■■■■■ 5.46
PITPNA-210ENST00000576722 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa49.13■■■■■ 5.46
PITPNA-210ENST00000576722 FGD5Q6ZNL6 1462 aa49.12■■■■■ 5.45
PITPNA-210ENST00000576722 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP49.1■■■■■ 5.45
PITPNA-210ENST00000576722 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.94■■■■■ 5.43
PITPNA-210ENST00000576722 WDR97A6NE52 1622 aa48.78■■■■■ 5.4
PITPNA-210ENST00000576722 FBLN2P98095 1184 aa48.71■■■■■ 5.39
PITPNA-210ENST00000576722 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.71■■■■■ 5.394e-6■■■■□ 21.5
PITPNA-210ENST00000576722 CHD1O14646 1710 aa48.68■■■■■ 5.38
PITPNA-210ENST00000576722 TOP2BQ02880 1626 aa48.62■■■■■ 5.37
PITPNA-210ENST00000576722 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.61■■■■■ 5.37
PITPNA-210ENST00000576722 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.61■■■■■ 5.37
PITPNA-210ENST00000576722 GRIN2BQ13224 1484 aa48.6■■■■■ 5.37
PITPNA-210ENST00000576722 SYNJ1O43426 1573 aa48.6■■■■■ 5.37
PITPNA-210ENST00000576722 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.59■■■■■ 5.37
PITPNA-210ENST00000576722 TRIM41Q8WV44 630 aa48.59■■■■■ 5.37
PITPNA-210ENST00000576722 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.54■■■■■ 5.36
PITPNA-210ENST00000576722 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP48.49■■■■■ 5.35
PITPNA-210ENST00000576722 PBRM1Q86U86 1689 aa48.45■■■■■ 5.35
PITPNA-210ENST00000576722 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP48.45■■■■■ 5.35
PITPNA-210ENST00000576722 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.43■■■■■ 5.34
PITPNA-210ENST00000576722 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.37■■■■■ 5.33
PITPNA-210ENST00000576722 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.37■■■■■ 5.33
PITPNA-210ENST00000576722 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.37■■■■■ 5.33
PITPNA-210ENST00000576722 SYNJ2O15056 1496 aa48.33■■■■■ 5.33
PITPNA-210ENST00000576722 ARHGEF11O15085 1522 aa48.29■■■■■ 5.32
PITPNA-210ENST00000576722 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.09■■■■■ 5.29
PITPNA-210ENST00000576722 ADAMTS12P58397 1594 aa48.01■■■■■ 5.28
PITPNA-210ENST00000576722 ERICH3Q5RHP9 1530 aa48■■■■■ 5.27
PITPNA-210ENST00000576722 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.98■■■■■ 5.27
PITPNA-210ENST00000576722 GRIN2AQ12879 1464 aa47.96■■■■■ 5.27
PITPNA-210ENST00000576722 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.95■■■■■ 5.27
PITPNA-210ENST00000576722 ARAP1Q96P48 1450 aa47.86■■■■■ 5.25
PITPNA-210ENST00000576722 CEP170Q5SW79 1584 aa47.74■■■■■ 5.23
PITPNA-210ENST00000576722 NUP160Q12769 1436 aa47.73■■■■■ 5.23
PITPNA-210ENST00000576722 KIF27Q86VH2 1401 aa47.73■■■■■ 5.23
PITPNA-210ENST00000576722 IGF1RP08069 1367 aa47.61■■■■■ 5.21
PITPNA-210ENST00000576722 CUL7Q14999 1698 aa47.48■■■■■ 5.19
PITPNA-210ENST00000576722 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.44■■■■■ 5.18
PITPNA-210ENST00000576722 SHROOM2Q13796 1616 aa47.42■■■■■ 5.18
PITPNA-210ENST00000576722 JPH4Q96JJ6 628 aa47.34■■■■■ 5.17
PITPNA-210ENST00000576722 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa47.34■■■■■ 5.17
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