RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532389.5

SERGEF-220, Transcript of secretion regulating guanine nucleotide exchange factor, humanhuman

TSL 5

Gene SERGEF, Length 833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERGEF-220ENST00000532389 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.84■■■■■ 5.89
SERGEF-220ENST00000532389 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.38■■■■■ 5.01
SERGEF-220ENST00000532389 ABCC9O60706 1549 aa46.04■■■■■ 4.96
SERGEF-220ENST00000532389 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.03■■■■■ 4.64
SERGEF-220ENST00000532389 NACADO15069 1562 aa43.8■■■■■ 4.6
SERGEF-220ENST00000532389 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.74■■■■■ 4.59
SERGEF-220ENST00000532389 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.3■■■■■ 4.52
SERGEF-220ENST00000532389 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.02■■■■■ 4.48
SERGEF-220ENST00000532389 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.93■■■■■ 4.46
SERGEF-220ENST00000532389 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.87■■■■■ 4.45
SERGEF-220ENST00000532389 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.87■■■■■ 4.45
SERGEF-220ENST00000532389 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.78■■■■■ 4.44
SERGEF-220ENST00000532389 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.59■■■■■ 4.41
SERGEF-220ENST00000532389 SCRIBQ14160 1630 aa42.26■■■■■ 4.36
SERGEF-220ENST00000532389 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.22■■■■■ 4.35
SERGEF-220ENST00000532389 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
SERGEF-220ENST00000532389 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.58■■■■■ 4.25
SERGEF-220ENST00000532389 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.47■■■■■ 4.23
SERGEF-220ENST00000532389 NCAPD3P42695 1498 aa40.41■■■■■ 4.06
SERGEF-220ENST00000532389 SMARCA4P51532 1647 aa40.35■■■■■ 4.05
SERGEF-220ENST00000532389 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.32■■■■■ 4.05
SERGEF-220ENST00000532389 SMARCA2P51531 1590 aa40.29■■■■■ 4.04
SERGEF-220ENST00000532389 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
SERGEF-220ENST00000532389 HMGXB3Q12766 1538 aa40.14■■■■■ 4.02
SERGEF-220ENST00000532389 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40■■■■□ 3.99
SERGEF-220ENST00000532389 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.95■■■■□ 3.99
SERGEF-220ENST00000532389 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.91■■■■□ 3.98
SERGEF-220ENST00000532389 ERCC6Q03468 1493 aa39.82■■■■□ 3.97
SERGEF-220ENST00000532389 NESP48681 1621 aa39.59■■■■□ 3.93
SERGEF-220ENST00000532389 CUX2O14529 1486 aa39.59■■■■□ 3.93
SERGEF-220ENST00000532389 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.46■■■■□ 3.91
SERGEF-220ENST00000532389 WIZO95785 1651 aa39.44■■■■□ 3.9
SERGEF-220ENST00000532389 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.29■■■■□ 3.88
SERGEF-220ENST00000532389 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.24■■■■□ 3.87
SERGEF-220ENST00000532389 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.23■■■■□ 3.87
SERGEF-220ENST00000532389 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.15■■■■□ 3.86
SERGEF-220ENST00000532389 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.12■■■■□ 3.85
SERGEF-220ENST00000532389 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.09■■■■□ 3.85
SERGEF-220ENST00000532389 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.03■■■■□ 3.84
SERGEF-220ENST00000532389 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.87■■■■□ 3.81
SERGEF-220ENST00000532389 CFTRP13569 1480 aa38.82■■■■□ 3.81
SERGEF-220ENST00000532389 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.8■■■■□ 3.8
SERGEF-220ENST00000532389 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.77■■■■□ 3.8
SERGEF-220ENST00000532389 WDR62O43379 1518 aa38.72■■■■□ 3.79
SERGEF-220ENST00000532389 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.57■■■■□ 3.76
SERGEF-220ENST00000532389 PRDM2Q13029 1718 aa38.43■■■■□ 3.74
SERGEF-220ENST00000532389 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.37■■■■□ 3.73
SERGEF-220ENST00000532389 ABCC8Q09428 1581 aa38.1■■■■□ 3.69
SERGEF-220ENST00000532389 TOPBP1Q92547 1522 aa38.05■■■■□ 3.68
SERGEF-220ENST00000532389 IFT140Q96RY7 1462 aa38.03■■■■□ 3.68
SERGEF-220ENST00000532389 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.96■■■■□ 3.67
SERGEF-220ENST00000532389 OSCARQ8IYS5 282 aa37.9■■■■□ 3.66
SERGEF-220ENST00000532389 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.86■■■■□ 3.65
SERGEF-220ENST00000532389 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.83■■■■□ 3.65
SERGEF-220ENST00000532389 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.68■■■■□ 3.62
SERGEF-220ENST00000532389 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.66■■■■□ 3.62
SERGEF-220ENST00000532389 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.64■■■■□ 3.62
SERGEF-220ENST00000532389 TRIM41Q8WV44 630 aa37.63■■■■□ 3.61
SERGEF-220ENST00000532389 SOGA1O94964 1423 aa37.57■■■■□ 3.6
SERGEF-220ENST00000532389 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.57■■■■□ 3.6
SERGEF-220ENST00000532389 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.52■■■■□ 3.6
SERGEF-220ENST00000532389 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.51■■■■□ 3.59
SERGEF-220ENST00000532389 CUX1P39880 1505 aa37.48■■■■□ 3.59
SERGEF-220ENST00000532389 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.42■■■■□ 3.58
SERGEF-220ENST00000532389 WDR97A6NE52 1622 aa37.38■■■■□ 3.57
SERGEF-220ENST00000532389 FBLN2P98095 1184 aa37.37■■■■□ 3.57
SERGEF-220ENST00000532389 CHD1O14646 1710 aa37.3■■■■□ 3.56
SERGEF-220ENST00000532389 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.23■■■■□ 3.55
SERGEF-220ENST00000532389 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.23■■■■□ 3.55
SERGEF-220ENST00000532389 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.23■■■■□ 3.55
SERGEF-220ENST00000532389 GRIN2BQ13224 1484 aa37.21■■■■□ 3.55
SERGEF-220ENST00000532389 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.21■■■■□ 3.55
SERGEF-220ENST00000532389 ARHGEF11O15085 1522 aa37.18■■■■□ 3.54
SERGEF-220ENST00000532389 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.17■■■■□ 3.54
SERGEF-220ENST00000532389 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.16■■■■□ 3.54
SERGEF-220ENST00000532389 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.11■■■■□ 3.53
SERGEF-220ENST00000532389 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.1■■■■□ 3.53
SERGEF-220ENST00000532389 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.1■■■■□ 3.53
SERGEF-220ENST00000532389 SYNJ2O15056 1496 aa37.03■■■■□ 3.52
SERGEF-220ENST00000532389 TOP2BQ02880 1626 aa37.01■■■■□ 3.52
SERGEF-220ENST00000532389 PBRM1Q86U86 1689 aa37■■■■□ 3.51
SERGEF-220ENST00000532389 SYNJ1O43426 1573 aa36.99■■■■□ 3.51
SERGEF-220ENST00000532389 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.99■■■■□ 3.51
SERGEF-220ENST00000532389 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.97■■■■□ 3.51
SERGEF-220ENST00000532389 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.96■■■■□ 3.51
SERGEF-220ENST00000532389 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.89■■■■□ 3.5
SERGEF-220ENST00000532389 ARAP1Q96P48 1450 aa36.82■■■■□ 3.48
SERGEF-220ENST00000532389 GRIN2AQ12879 1464 aa36.69■■■■□ 3.46
SERGEF-220ENST00000532389 ADAMTS12P58397 1594 aa36.69■■■■□ 3.46
SERGEF-220ENST00000532389 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.68■■■■□ 3.46
SERGEF-220ENST00000532389 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.67■■■■□ 3.46
SERGEF-220ENST00000532389 NUP160Q12769 1436 aa36.54■■■■□ 3.44
SERGEF-220ENST00000532389 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
SERGEF-220ENST00000532389 CEP170Q5SW79 1584 aa36.49■■■■□ 3.43
SERGEF-220ENST00000532389 KIF27Q86VH2 1401 aa36.39■■■■□ 3.42
SERGEF-220ENST00000532389 SHROOM2Q13796 1616 aa36.3■■■■□ 3.4
SERGEF-220ENST00000532389 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.28■■■■□ 3.4
SERGEF-220ENST00000532389 IGF1RP08069 1367 aa36.27■■■■□ 3.4
SERGEF-220ENST00000532389 JPH4Q96JJ6 628 aa36.24■■■■□ 3.39
SERGEF-220ENST00000532389 CUL7Q14999 1698 aa36.21■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.8 ms