RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530613.5

SERGEF-213, Transcript of secretion regulating guanine nucleotide exchange factor, humanhuman

TSL 5

Gene SERGEF, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERGEF-213ENST00000530613 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.88■■■■■ 6.38
SERGEF-213ENST00000530613 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.12■■■■■ 5.45
SERGEF-213ENST00000530613 ABCC9O60706 1549 aa48.9■■■■■ 5.42
SERGEF-213ENST00000530613 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.63■■■■■ 5.06
SERGEF-213ENST00000530613 NACADO15069 1562 aa46.38■■■■■ 5.01
SERGEF-213ENST00000530613 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.27■■■■■ 5
SERGEF-213ENST00000530613 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.78■■■■■ 4.92
SERGEF-213ENST00000530613 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.73■■■■■ 4.91
SERGEF-213ENST00000530613 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.72■■■■■ 4.91
SERGEF-213ENST00000530613 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.61■■■■■ 4.89
SERGEF-213ENST00000530613 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.5■■■■■ 4.87
SERGEF-213ENST00000530613 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.33■■■■■ 4.85
SERGEF-213ENST00000530613 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.31■■■■■ 4.84
SERGEF-213ENST00000530613 SCRIBQ14160 1630 aa44.79■■■■■ 4.76
SERGEF-213ENST00000530613 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.59■■■■■ 4.73
SERGEF-213ENST00000530613 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.2■■■■■ 4.67
SERGEF-213ENST00000530613 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.14■■■■■ 4.66
SERGEF-213ENST00000530613 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.01■■■■■ 4.64
SERGEF-213ENST00000530613 NCAPD3P42695 1498 aa42.81■■■■■ 4.44
SERGEF-213ENST00000530613 SMARCA4P51532 1647 aa42.76■■■■■ 4.44
SERGEF-213ENST00000530613 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.73■■■■■ 4.43
SERGEF-213ENST00000530613 SMARCA2P51531 1590 aa42.6■■■■■ 4.41
SERGEF-213ENST00000530613 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.55■■■■■ 4.4
SERGEF-213ENST00000530613 HMGXB3Q12766 1538 aa42.49■■■■■ 4.39
SERGEF-213ENST00000530613 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.31■■■■■ 4.36
SERGEF-213ENST00000530613 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.31■■■■■ 4.36
SERGEF-213ENST00000530613 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.3■■■■■ 4.36
SERGEF-213ENST00000530613 ERCC6Q03468 1493 aa42.16■■■■■ 4.34
SERGEF-213ENST00000530613 NESP48681 1621 aa42.11■■■■■ 4.33
SERGEF-213ENST00000530613 CUX2O14529 1486 aa41.98■■■■■ 4.31
SERGEF-213ENST00000530613 WIZO95785 1651 aa41.86■■■■■ 4.29
SERGEF-213ENST00000530613 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.8■■■■■ 4.28
SERGEF-213ENST00000530613 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.75■■■■■ 4.27
SERGEF-213ENST00000530613 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.6■■■■■ 4.25
SERGEF-213ENST00000530613 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
SERGEF-213ENST00000530613 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.53■■■■■ 4.24
SERGEF-213ENST00000530613 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.53■■■■■ 4.24
SERGEF-213ENST00000530613 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
SERGEF-213ENST00000530613 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
SERGEF-213ENST00000530613 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.16■■■■■ 4.18
SERGEF-213ENST00000530613 CFTRP13569 1480 aa41.1■■■■■ 4.17
SERGEF-213ENST00000530613 WDR62O43379 1518 aa41.06■■■■■ 4.16
SERGEF-213ENST00000530613 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.05■■■■■ 4.16
SERGEF-213ENST00000530613 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.05■■■■■ 4.16
SERGEF-213ENST00000530613 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.83■■■■■ 4.13
SERGEF-213ENST00000530613 PRDM2Q13029 1718 aa40.79■■■■■ 4.12
SERGEF-213ENST00000530613 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
SERGEF-213ENST00000530613 TOPBP1Q92547 1522 aa40.32■■■■■ 4.04
SERGEF-213ENST00000530613 IFT140Q96RY7 1462 aa40.22■■■■■ 4.03
SERGEF-213ENST00000530613 ABCC8Q09428 1581 aa40.22■■■■■ 4.03
SERGEF-213ENST00000530613 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
SERGEF-213ENST00000530613 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.18■■■■■ 4.02
SERGEF-213ENST00000530613 OSCARQ8IYS5 282 aa40.17■■■■■ 4.02
SERGEF-213ENST00000530613 TRIM41Q8WV44 630 aa40.03■■■■■ 4
SERGEF-213ENST00000530613 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.97■■■■□ 3.99
SERGEF-213ENST00000530613 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.95■■■■□ 3.99
SERGEF-213ENST00000530613 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.92■■■■□ 3.98
SERGEF-213ENST00000530613 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.91■■■■□ 3.98
SERGEF-213ENST00000530613 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.87■■■■□ 3.97
SERGEF-213ENST00000530613 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.8■■■■□ 3.96
SERGEF-213ENST00000530613 SOGA1O94964 1423 aa39.75■■■■□ 3.95
SERGEF-213ENST00000530613 CUX1P39880 1505 aa39.73■■■■□ 3.95
SERGEF-213ENST00000530613 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.7■■■■□ 3.95
SERGEF-213ENST00000530613 CHD1O14646 1710 aa39.68■■■■□ 3.94
SERGEF-213ENST00000530613 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.65■■■■□ 3.94
SERGEF-213ENST00000530613 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.64■■■■□ 3.94
SERGEF-213ENST00000530613 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.64■■■■□ 3.94
SERGEF-213ENST00000530613 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.64■■■■□ 3.94
SERGEF-213ENST00000530613 FBLN2P98095 1184 aa39.54■■■■□ 3.92
SERGEF-213ENST00000530613 ARHGEF11O15085 1522 aa39.5■■■■□ 3.91
SERGEF-213ENST00000530613 WDR97A6NE52 1622 aa39.5■■■■□ 3.91
SERGEF-213ENST00000530613 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.43■■■■□ 3.9
SERGEF-213ENST00000530613 GRIN2BQ13224 1484 aa39.35■■■■□ 3.89
SERGEF-213ENST00000530613 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.31■■■■□ 3.88
SERGEF-213ENST00000530613 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.28■■■■□ 3.88
SERGEF-213ENST00000530613 PBRM1Q86U86 1689 aa39.27■■■■□ 3.88
SERGEF-213ENST00000530613 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.26■■■■□ 3.88
SERGEF-213ENST00000530613 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.25■■■■□ 3.87
SERGEF-213ENST00000530613 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.25■■■■□ 3.87
SERGEF-213ENST00000530613 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.19■■■■□ 3.86
SERGEF-213ENST00000530613 SYNJ2O15056 1496 aa39.18■■■■□ 3.86
SERGEF-213ENST00000530613 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.17■■■■□ 3.86
SERGEF-213ENST00000530613 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.15■■■■□ 3.86
SERGEF-213ENST00000530613 TOP2BQ02880 1626 aa39.14■■■■□ 3.86
SERGEF-213ENST00000530613 SYNJ1O43426 1573 aa39.14■■■■□ 3.86
SERGEF-213ENST00000530613 ARAP1Q96P48 1450 aa39.14■■■■□ 3.86
SERGEF-213ENST00000530613 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.14■■■■□ 3.86
SERGEF-213ENST00000530613 ADAMTS12P58397 1594 aa38.85■■■■□ 3.81
SERGEF-213ENST00000530613 GRIN2AQ12879 1464 aa38.85■■■■□ 3.81
SERGEF-213ENST00000530613 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.76■■■■□ 3.8
SERGEF-213ENST00000530613 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.76■■■■□ 3.8
SERGEF-213ENST00000530613 CEP170Q5SW79 1584 aa38.73■■■■□ 3.79
SERGEF-213ENST00000530613 NUP160Q12769 1436 aa38.71■■■■□ 3.79
SERGEF-213ENST00000530613 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.7■■■■□ 3.79
SERGEF-213ENST00000530613 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.62■■■■□ 3.77
SERGEF-213ENST00000530613 SHROOM2Q13796 1616 aa38.53■■■■□ 3.76
SERGEF-213ENST00000530613 IGF1RP08069 1367 aa38.37■■■■□ 3.73
SERGEF-213ENST00000530613 KIF27Q86VH2 1401 aa38.37■■■■□ 3.73
SERGEF-213ENST00000530613 JPH4Q96JJ6 628 aa38.36■■■■□ 3.73
SERGEF-213ENST00000530613 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.33■■■■□ 3.73
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