Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAB5AP20339 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB5AP20339 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms