Protein–RNA interactions for Protein: P03956

MMP1, Interstitial collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP1P03956 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP1P03956 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP1P03956 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP1P03956 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP1P03956 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP1P03956 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP1P03956 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP1P03956 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP1P03956 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP1P03956 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP1P03956 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP1P03956 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP1P03956 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP1P03956 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP1P03956 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP1P03956 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP1P03956 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP1P03956 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP1P03956 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP1P03956 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP1P03956 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP1P03956 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP1P03956 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP1P03956 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP1P03956 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP1P03956 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP1P03956 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP1P03956 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP1P03956 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP1P03956 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP1P03956 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MMP1P03956 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MMP1P03956 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MMP1P03956 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MMP1P03956 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MMP1P03956 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MMP1P03956 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MMP1P03956 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMP1P03956 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMP1P03956 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMP1P03956 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMP1P03956 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMP1P03956 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMP1P03956 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMP1P03956 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MMP1P03956 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MMP1P03956 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MMP1P03956 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MMP1P03956 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MMP1P03956 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MMP1P03956 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MMP1P03956 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP1P03956 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP1P03956 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP1P03956 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP1P03956 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP1P03956 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP1P03956 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP1P03956 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP1P03956 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP1P03956 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP1P03956 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP1P03956 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP1P03956 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP1P03956 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP1P03956 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP1P03956 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP1P03956 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP1P03956 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP1P03956 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP1P03956 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP1P03956 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP1P03956 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP1P03956 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP1P03956 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP1P03956 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP1P03956 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP1P03956 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP1P03956 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP1P03956 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP1P03956 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP1P03956 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP1P03956 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP1P03956 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP1P03956 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP1P03956 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP1P03956 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP1P03956 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MMP1P03956 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MMP1P03956 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MMP1P03956 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MMP1P03956 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MMP1P03956 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MMP1P03956 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MMP1P03956 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MMP1P03956 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MMP1P03956 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MMP1P03956 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MMP1P03956 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MMP1P03956 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms