Protein–RNA interactions for Protein: O43508

TNFSF12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12O43508 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TNFSF12O43508 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms