Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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IFT27Q9BW83 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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IFT27Q9BW83 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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IFT27Q9BW83 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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IFT27Q9BW83 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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IFT27Q9BW83 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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IFT27Q9BW83 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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IFT27Q9BW83 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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IFT27Q9BW83 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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IFT27Q9BW83 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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IFT27Q9BW83 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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IFT27Q9BW83 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
IFT27Q9BW83 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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