Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BHLHA9Q7RTU4 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms