Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDN1P05305 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDN1P05305 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDN1P05305 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDN1P05305 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDN1P05305 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDN1P05305 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDN1P05305 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDN1P05305 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDN1P05305 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDN1P05305 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDN1P05305 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDN1P05305 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDN1P05305 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EDN1P05305 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EDN1P05305 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EDN1P05305 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms