Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LETM2Q2VYF4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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