Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
REG3AQ06141 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms