Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GPC1P35052 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GPC1P35052 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GPC1P35052 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GPC1P35052 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GPC1P35052 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GPC1P35052 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GPC1P35052 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GPC1P35052 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GPC1P35052 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GPC1P35052 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GPC1P35052 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GPC1P35052 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GPC1P35052 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GPC1P35052 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GPC1P35052 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GPC1P35052 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GPC1P35052 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GPC1P35052 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GPC1P35052 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GPC1P35052 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GPC1P35052 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GPC1P35052 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GPC1P35052 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GPC1P35052 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GPC1P35052 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms