Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVV-2B6SEH9 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms