Protein–RNA interactions for Protein: Q12834

CDC20, Cell division cycle protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20Q12834 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CDC20Q12834 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CDC20Q12834 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms