Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RAB39AQ14964 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms