Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms