Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM5Q9C035 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM5Q9C035 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM5Q9C035 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM5Q9C035 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM5Q9C035 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms