Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KCNMB4Q86W47 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 305.1 ms