Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 GUCY1A3-207ENST00000511108 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 DHX30-206ENST00000446256 3660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
ANKRD39Q53RE8 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 FBLN5-201ENST00000267620 2423 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AP002754.1-201ENST00000506329 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 RTN1-203ENST00000395090 1609 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 SRRM5-201ENST00000417606 2381 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 TM9SF2-201ENST00000376387 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 TMEM8B-201ENST00000377988 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 PHACTR3-201ENST00000355648 2247 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms