Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GPS1Q13098 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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