Protein–RNA interactions for Protein: Q11206

ST3GAL4, CMP-N-acetylneuraminate-beta-galactosamide-alpha-2,3-sialyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST3GAL4Q11206 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ST3GAL4Q11206 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ST3GAL4Q11206 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ST3GAL4Q11206 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ST3GAL4Q11206 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ST3GAL4Q11206 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ST3GAL4Q11206 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ST3GAL4Q11206 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ST3GAL4Q11206 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms