Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDSP20132 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDSP20132 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDSP20132 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SDSP20132 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDSP20132 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDSP20132 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDSP20132 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDSP20132 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDSP20132 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDSP20132 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SDSP20132 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SDSP20132 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDSP20132 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDSP20132 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDSP20132 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDSP20132 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDSP20132 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDSP20132 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDSP20132 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDSP20132 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDSP20132 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDSP20132 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDSP20132 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDSP20132 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDSP20132 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDSP20132 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDSP20132 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDSP20132 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDSP20132 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDSP20132 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SDSP20132 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDSP20132 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDSP20132 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDSP20132 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDSP20132 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SDSP20132 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDSP20132 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDSP20132 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDSP20132 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDSP20132 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SDSP20132 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDSP20132 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDSP20132 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDSP20132 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDSP20132 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SDSP20132 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SDSP20132 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDSP20132 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDSP20132 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDSP20132 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDSP20132 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDSP20132 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDSP20132 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDSP20132 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDSP20132 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDSP20132 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDSP20132 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDSP20132 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDSP20132 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDSP20132 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SDSP20132 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms