Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 CDC25B-201ENST00000245960 3597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.413e-6■■■■■ 91.2
SF3B1O75533 CAMKK2-216ENST00000545538 3797 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.564e-6■■■■■ 91.2
SF3B1O75533 TMEM94-202ENST00000375248 4703 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.632e-11■■■■■ 91.2
SF3B1O75533 NPLOC4-208ENST00000572351 460 ntTSL 510.16□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 91.2
SF3B1O75533 ZMYM2-211ENST00000620447 1069 ntTSL 1 (best)3.49□□□□□ -1.854e-6■■■■■ 91.2
SF3B1O75533 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.772e-6■■■■■ 91.2
SF3B1O75533 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 91.2
SF3B1O75533 TFDP2-213ENST00000487734 1469 ntTSL 58.61□□□□□ -1.032e-6■■■■■ 91.2
SF3B1O75533 FASTK-208ENST00000467237 3011 ntTSL 1 (best)15.3■□□□□ 0.043e-7■■■■■ 91.2
SF3B1O75533 RHEB-203ENST00000470370 501 ntTSL 54.08□□□□□ -1.761e-6■■■■■ 91.2
SF3B1O75533 COG7-201ENST00000307149 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.366e-6■■■■■ 91.1
SF3B1O75533 PAIP1-204ENST00000504075 501 ntTSL 325.68■■□□□ 1.71e-6■■■■■ 91.1
SF3B1O75533 PAIP1-210ENST00000515338 726 ntTSL 55.41□□□□□ -1.541e-6■■■■■ 91.1
SF3B1O75533 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.045e-7■■■■■ 91.1
SF3B1O75533 ABCA11P-203ENST00000507854 1503 ntTSL 1 (best)11.06□□□□□ -0.642e-6■■■■■ 91
SF3B1O75533 ABCA11P-201ENST00000451020 1815 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.932e-6■■■■■ 91
SF3B1O75533 ZNF721-206ENST00000515578 1679 ntTSL 1 (best)9.02□□□□□ -0.962e-6■■■■■ 91
SF3B1O75533 ZNF721-203ENST00000506646 935 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 91
SF3B1O75533 ABCA11P-204ENST00000514396 1423 ntTSL 1 (best)6.94□□□□□ -1.32e-6■■■■■ 91
SF3B1O75533 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.14e-6■■■■■ 91
SF3B1O75533 MTA1-208ENST00000438610 2144 ntTSL 1 (best)19.48■□□□□ 0.714e-6■■■■■ 91
SF3B1O75533 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.634e-6■■■■■ 91
SF3B1O75533 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.584e-6■■■■■ 91
SF3B1O75533 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.214e-6■■■■■ 91
SF3B1O75533 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.094e-6■■■■■ 91
SF3B1O75533 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 90.9
SF3B1O75533 ELP1-204ENST00000537196 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.451e-6■■■■■ 90.9
SF3B1O75533 RHEB-205ENST00000478470 1153 ntTSL 527.54■■■□□ 21e-6■■■■■ 90.9
SF3B1O75533 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.761e-6■■■■■ 90.9
SF3B1O75533 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.161e-6■■■■■ 90.9
SF3B1O75533 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 90.9
SF3B1O75533 PCNT-201ENST00000359568 10560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.686e-6■■■■■ 90.9
SF3B1O75533 LIN28B-202ENST00000635857 912 ntTSL 518.57■□□□□ 0.568e-7■■■■■ 90.9
SF3B1O75533 LIN28B-203ENST00000637759 2635 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.228e-7■■■■■ 90.9
SF3B1O75533 MAN1B1-211ENST00000540391 3940 ntTSL 211.14□□□□□ -0.633e-6■■■■■ 90.9
SF3B1O75533 LIN28B-201ENST00000345080 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.178e-7■■■■■ 90.9
SF3B1O75533 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.486e-6■■■■■ 90.9
SF3B1O75533 AC010519.1-201ENST00000599924 344 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.216e-6■■■■■ 90.9
SF3B1O75533 TIAM2-208ENST00000461783 6981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.968e-9■■■■■ 90.8
SF3B1O75533 TIAM2-213ENST00000535064 768 ntTSL 56.95□□□□□ -1.38e-9■■■■■ 90.8
SF3B1O75533 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.317e-8■■■■■ 90.7
SF3B1O75533 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.57e-8■■■■■ 90.7
SF3B1O75533 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.527e-8■■■■■ 90.7
SF3B1O75533 AC005726.2-202ENST00000531839 1033 ntAPPRIS P5 TSL 212.36□□□□□ -0.431e-6■■■■■ 90.7
SF3B1O75533 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.442e-6■■■■■ 90.7
SF3B1O75533 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.632e-6■■■■■ 90.7
SF3B1O75533 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.782e-6■■■■■ 90.7
SF3B1O75533 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.296e-6■■■■■ 90.7
SF3B1O75533 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.096e-6■■■■■ 90.7
SF3B1O75533 TPM4-208ENST00000588410 563 ntTSL 421.44■■□□□ 1.026e-8■■■■■ 90.6
SF3B1O75533 TPM4-204ENST00000586499 708 ntTSL 420.82■□□□□ 0.926e-8■■■■■ 90.6
SF3B1O75533 TPM4-206ENST00000587201 877 ntTSL 219.4■□□□□ 0.76e-8■■■■■ 90.6
SF3B1O75533 GLG1-209ENST00000565260 461 ntTSL 529.72■■■□□ 2.352e-6■■■■■ 90.6
SF3B1O75533 PCYT2-207ENST00000571581 999 ntTSL 528.34■■■□□ 2.134e-6■■■■■ 90.6
SF3B1O75533 PCYT2-213ENST00000573401 1028 ntTSL 526.88■■□□□ 1.894e-6■■■■■ 90.6
SF3B1O75533 PCYT2-214ENST00000573636 913 ntTSL 526.31■■□□□ 1.84e-6■■■■■ 90.6
SF3B1O75533 PCYT2-215ENST00000573927 778 ntTSL 317.86■□□□□ 0.454e-6■■■■■ 90.6
SF3B1O75533 FNDC3B-201ENST00000336824 7904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.844e-6■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 FNDC3B-203ENST00000416957 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.134e-6■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.132e-6■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 EIPR1-204ENST00000435721 672 ntTSL 320.74■□□□□ 0.912e-6■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 EIPR1-205ENST00000441271 647 ntTSL 518.79■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 DBF4B-207ENST00000528353 2495 ntTSL 214.05□□□□□ -0.166e-6■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 DBF4B-204ENST00000526915 562 ntTSL 311.84□□□□□ -0.516e-6■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 MFSD2B-203ENST00000453731 674 ntTSL 311.38□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 EIPR1-208ENST00000455162 847 ntTSL 511.18□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 EIPR1-210ENST00000463662 757 ntTSL 39.66□□□□□ -0.862e-6■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 CHD9-217ENST00000565832 2169 ntTSL 1 (best)6.44□□□□□ -1.384e-6■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 WDR1-212ENST00000508949 552 ntTSL 416.24■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 WDR1-208ENST00000505543 687 ntTSL 414.37□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 VPS37B-203ENST00000535765 879 ntTSL 325.57■■□□□ 1.681e-6■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 PDPK1-215ENST00000566659 451 ntTSL 322.4■■□□□ 1.185e-12■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 PDPK1-207ENST00000462923 550 ntTSL 522.4■■□□□ 1.185e-12■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 SS18-224ENST00000584083 663 ntTSL 422.35■■□□□ 1.172e-6■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 ZZZ3-203ENST00000414381 561 ntTSL 422.33■■□□□ 1.172e-7■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.162e-9■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 CEP350-210ENST00000491495 1059 ntTSL 521.98■■□□□ 1.112e-6■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 SS18-218ENST00000581021 588 ntTSL 421.92■■□□□ 1.12e-6■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 17e-7■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 PDPK1-213ENST00000492021 552 ntTSL 520.91■□□□□ 0.945e-12■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 ZZZ3-206ENST00000463166 587 ntTSL 220.37■□□□□ 0.852e-7■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.571e-6■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 GNB4-205ENST00000497513 571 ntTSL 417.39■□□□□ 0.372e-9■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 PDPK1-217ENST00000570136 1125 ntTSL 216.33■□□□□ 0.25e-12■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 TXNL1-206ENST00000587807 2035 ntTSL 216.26■□□□□ 0.197e-7■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 C1orf159-210ENST00000464905 650 ntTSL 315.94■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 C1orf159-219ENST00000487177 3315 ntTSL 215.92■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 UQCRC1-209ENST00000480561 1014 ntTSL 215.91■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.122e-9■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 BRCA1-218ENST00000489037 455 ntTSL 415.6■□□□□ 0.092e-9■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 FAM98C-203ENST00000585954 330 ntTSL 315.24■□□□□ 0.032e-9■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.055e-6■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 PDPK1-210ENST00000474706 699 ntTSL 514.62□□□□□ -0.075e-12■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 UQCRC1-207ENST00000471189 955 ntTSL 314.46□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.155e-6■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.235e-6■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.315e-6■■■■■ 90.5
SF3B1O75533 TXNL1-201ENST00000217515 6894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.587e-7■■■■■ 90.5
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1342.4 ms