Protein–RNA interactions for Protein: P47804

RGR, RPE-retinal G protein-coupled receptor, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGRP47804 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGRP47804 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGRP47804 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGRP47804 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGRP47804 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGRP47804 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGRP47804 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RGRP47804 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGRP47804 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGRP47804 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGRP47804 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGRP47804 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGRP47804 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGRP47804 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGRP47804 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGRP47804 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGRP47804 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms