Protein–RNA interactions for Protein: P08709

F7, Coagulation factor VII, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F7P08709 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F7P08709 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F7P08709 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F7P08709 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F7P08709 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F7P08709 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F7P08709 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F7P08709 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F7P08709 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
F7P08709 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
F7P08709 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
F7P08709 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
F7P08709 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
F7P08709 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
F7P08709 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
F7P08709 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
F7P08709 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
F7P08709 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F7P08709 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F7P08709 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F7P08709 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F7P08709 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F7P08709 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F7P08709 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F7P08709 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F7P08709 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
F7P08709 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F7P08709 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F7P08709 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
F7P08709 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
F7P08709 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
F7P08709 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F7P08709 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
F7P08709 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F7P08709 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F7P08709 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
F7P08709 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F7P08709 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F7P08709 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F7P08709 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F7P08709 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F7P08709 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F7P08709 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F7P08709 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F7P08709 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
F7P08709 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F7P08709 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F7P08709 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F7P08709 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
F7P08709 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms