Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASQ1P31415 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
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CASQ1P31415 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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CASQ1P31415 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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CASQ1P31415 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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CASQ1P31415 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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CASQ1P31415 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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CASQ1P31415 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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CASQ1P31415 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASQ1P31415 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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