Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EBF1Q9UH73 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EBF1Q9UH73 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms