Protein–RNA interactions for Protein: Q9H159

CDH19, Cadherin-19, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH19Q9H159 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH19Q9H159 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH19Q9H159 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms