Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT9

RNPC3, RNA-binding protein 40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3Q96LT9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNPC3Q96LT9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNPC3Q96LT9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNPC3Q96LT9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNPC3Q96LT9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNPC3Q96LT9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNPC3Q96LT9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RNPC3Q96LT9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNPC3Q96LT9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNPC3Q96LT9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNPC3Q96LT9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNPC3Q96LT9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNPC3Q96LT9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNPC3Q96LT9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNPC3Q96LT9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNPC3Q96LT9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNPC3Q96LT9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNPC3Q96LT9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms