Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVS4

WDR60, WD repeat-containing protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR60Q8WVS4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
WDR60Q8WVS4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR60Q8WVS4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
WDR60Q8WVS4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
WDR60Q8WVS4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
WDR60Q8WVS4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
WDR60Q8WVS4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
WDR60Q8WVS4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
WDR60Q8WVS4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
WDR60Q8WVS4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR60Q8WVS4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR60Q8WVS4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR60Q8WVS4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR60Q8WVS4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR60Q8WVS4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR60Q8WVS4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR60Q8WVS4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR60Q8WVS4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR60Q8WVS4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR60Q8WVS4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR60Q8WVS4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR60Q8WVS4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR60Q8WVS4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR60Q8WVS4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR60Q8WVS4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR60Q8WVS4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR60Q8WVS4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR60Q8WVS4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR60Q8WVS4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR60Q8WVS4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR60Q8WVS4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR60Q8WVS4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR60Q8WVS4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR60Q8WVS4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR60Q8WVS4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms