Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVS4

WDR60, WD repeat-containing protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR60Q8WVS4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
WDR60Q8WVS4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
WDR60Q8WVS4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
WDR60Q8WVS4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
WDR60Q8WVS4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
WDR60Q8WVS4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
WDR60Q8WVS4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
WDR60Q8WVS4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
WDR60Q8WVS4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
WDR60Q8WVS4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
WDR60Q8WVS4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
WDR60Q8WVS4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
WDR60Q8WVS4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
WDR60Q8WVS4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
WDR60Q8WVS4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
WDR60Q8WVS4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
WDR60Q8WVS4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
WDR60Q8WVS4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
WDR60Q8WVS4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
WDR60Q8WVS4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
WDR60Q8WVS4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
WDR60Q8WVS4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
WDR60Q8WVS4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
WDR60Q8WVS4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
WDR60Q8WVS4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
WDR60Q8WVS4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
WDR60Q8WVS4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
WDR60Q8WVS4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
WDR60Q8WVS4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
WDR60Q8WVS4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
WDR60Q8WVS4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
WDR60Q8WVS4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
WDR60Q8WVS4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
WDR60Q8WVS4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
WDR60Q8WVS4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
WDR60Q8WVS4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
WDR60Q8WVS4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
WDR60Q8WVS4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
WDR60Q8WVS4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
WDR60Q8WVS4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
WDR60Q8WVS4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
WDR60Q8WVS4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
WDR60Q8WVS4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
WDR60Q8WVS4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
WDR60Q8WVS4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
WDR60Q8WVS4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
WDR60Q8WVS4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
WDR60Q8WVS4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
WDR60Q8WVS4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
WDR60Q8WVS4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
WDR60Q8WVS4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
WDR60Q8WVS4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
WDR60Q8WVS4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
WDR60Q8WVS4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
WDR60Q8WVS4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
WDR60Q8WVS4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
WDR60Q8WVS4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
WDR60Q8WVS4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
WDR60Q8WVS4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
WDR60Q8WVS4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
WDR60Q8WVS4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
WDR60Q8WVS4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
WDR60Q8WVS4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
WDR60Q8WVS4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
WDR60Q8WVS4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
WDR60Q8WVS4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
WDR60Q8WVS4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
WDR60Q8WVS4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
WDR60Q8WVS4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
WDR60Q8WVS4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
WDR60Q8WVS4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
WDR60Q8WVS4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
WDR60Q8WVS4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
WDR60Q8WVS4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
WDR60Q8WVS4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
WDR60Q8WVS4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
WDR60Q8WVS4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
WDR60Q8WVS4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
WDR60Q8WVS4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
WDR60Q8WVS4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
WDR60Q8WVS4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
WDR60Q8WVS4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
WDR60Q8WVS4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
WDR60Q8WVS4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
WDR60Q8WVS4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
WDR60Q8WVS4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
WDR60Q8WVS4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
WDR60Q8WVS4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
WDR60Q8WVS4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
WDR60Q8WVS4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
WDR60Q8WVS4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
WDR60Q8WVS4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
WDR60Q8WVS4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
WDR60Q8WVS4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
WDR60Q8WVS4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
WDR60Q8WVS4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
WDR60Q8WVS4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
WDR60Q8WVS4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
WDR60Q8WVS4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
WDR60Q8WVS4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms