Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR6A1Q15406 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NR6A1Q15406 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NR6A1Q15406 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NR6A1Q15406 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
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