Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCSHP23434 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCSHP23434 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCSHP23434 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCSHP23434 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCSHP23434 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCSHP23434 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCSHP23434 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCSHP23434 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCSHP23434 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCSHP23434 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCSHP23434 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCSHP23434 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GCSHP23434 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSHP23434 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSHP23434 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSHP23434 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSHP23434 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSHP23434 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSHP23434 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSHP23434 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSHP23434 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSHP23434 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCSHP23434 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCSHP23434 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCSHP23434 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCSHP23434 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCSHP23434 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCSHP23434 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCSHP23434 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCSHP23434 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCSHP23434 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GCSHP23434 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCSHP23434 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCSHP23434 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCSHP23434 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCSHP23434 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GCSHP23434 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCSHP23434 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCSHP23434 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCSHP23434 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCSHP23434 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCSHP23434 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCSHP23434 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCSHP23434 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCSHP23434 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCSHP23434 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCSHP23434 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCSHP23434 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCSHP23434 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCSHP23434 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCSHP23434 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCSHP23434 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCSHP23434 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GCSHP23434 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCSHP23434 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCSHP23434 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCSHP23434 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCSHP23434 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCSHP23434 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCSHP23434 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCSHP23434 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCSHP23434 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCSHP23434 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCSHP23434 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCSHP23434 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCSHP23434 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCSHP23434 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCSHP23434 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GCSHP23434 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GCSHP23434 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCSHP23434 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCSHP23434 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCSHP23434 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCSHP23434 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCSHP23434 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCSHP23434 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCSHP23434 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCSHP23434 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCSHP23434 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCSHP23434 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCSHP23434 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GCSHP23434 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCSHP23434 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCSHP23434 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCSHP23434 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCSHP23434 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCSHP23434 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCSHP23434 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCSHP23434 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCSHP23434 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCSHP23434 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GCSHP23434 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCSHP23434 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCSHP23434 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCSHP23434 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCSHP23434 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCSHP23434 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCSHP23434 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GCSHP23434 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms