Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCSHP23434 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCSHP23434 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCSHP23434 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCSHP23434 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCSHP23434 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCSHP23434 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCSHP23434 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GCSHP23434 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCSHP23434 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCSHP23434 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCSHP23434 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GCSHP23434 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCSHP23434 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCSHP23434 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCSHP23434 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCSHP23434 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCSHP23434 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCSHP23434 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCSHP23434 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCSHP23434 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCSHP23434 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCSHP23434 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCSHP23434 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCSHP23434 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCSHP23434 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCSHP23434 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCSHP23434 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCSHP23434 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCSHP23434 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCSHP23434 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCSHP23434 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCSHP23434 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GCSHP23434 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCSHP23434 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCSHP23434 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCSHP23434 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCSHP23434 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCSHP23434 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCSHP23434 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCSHP23434 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCSHP23434 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCSHP23434 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCSHP23434 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCSHP23434 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCSHP23434 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCSHP23434 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCSHP23434 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCSHP23434 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCSHP23434 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCSHP23434 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCSHP23434 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCSHP23434 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GCSHP23434 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GCSHP23434 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GCSHP23434 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCSHP23434 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCSHP23434 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCSHP23434 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCSHP23434 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCSHP23434 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCSHP23434 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCSHP23434 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCSHP23434 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GCSHP23434 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GCSHP23434 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCSHP23434 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GCSHP23434 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCSHP23434 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCSHP23434 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCSHP23434 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCSHP23434 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GCSHP23434 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCSHP23434 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCSHP23434 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCSHP23434 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GCSHP23434 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GCSHP23434 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GCSHP23434 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GCSHP23434 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GCSHP23434 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GCSHP23434 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCSHP23434 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCSHP23434 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCSHP23434 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCSHP23434 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GCSHP23434 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCSHP23434 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCSHP23434 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCSHP23434 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCSHP23434 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCSHP23434 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCSHP23434 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCSHP23434 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GCSHP23434 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GCSHP23434 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCSHP23434 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GCSHP23434 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GCSHP23434 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GCSHP23434 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms