Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRAFP15056 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BRAFP15056 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRAFP15056 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRAFP15056 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRAFP15056 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRAFP15056 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRAFP15056 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRAFP15056 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRAFP15056 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRAFP15056 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRAFP15056 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRAFP15056 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRAFP15056 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRAFP15056 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRAFP15056 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRAFP15056 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRAFP15056 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRAFP15056 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRAFP15056 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRAFP15056 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRAFP15056 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRAFP15056 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRAFP15056 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRAFP15056 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRAFP15056 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRAFP15056 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRAFP15056 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRAFP15056 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRAFP15056 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRAFP15056 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRAFP15056 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRAFP15056 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRAFP15056 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRAFP15056 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRAFP15056 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRAFP15056 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRAFP15056 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BRAFP15056 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRAFP15056 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRAFP15056 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRAFP15056 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRAFP15056 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRAFP15056 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRAFP15056 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRAFP15056 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRAFP15056 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRAFP15056 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRAFP15056 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRAFP15056 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRAFP15056 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRAFP15056 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRAFP15056 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRAFP15056 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRAFP15056 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BRAFP15056 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRAFP15056 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRAFP15056 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRAFP15056 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRAFP15056 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRAFP15056 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRAFP15056 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRAFP15056 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRAFP15056 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRAFP15056 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRAFP15056 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRAFP15056 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BRAFP15056 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRAFP15056 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRAFP15056 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRAFP15056 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRAFP15056 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRAFP15056 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRAFP15056 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BRAFP15056 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRAFP15056 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRAFP15056 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRAFP15056 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRAFP15056 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRAFP15056 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRAFP15056 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRAFP15056 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRAFP15056 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRAFP15056 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRAFP15056 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRAFP15056 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRAFP15056 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BRAFP15056 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRAFP15056 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRAFP15056 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRAFP15056 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRAFP15056 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRAFP15056 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRAFP15056 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRAFP15056 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BRAFP15056 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRAFP15056 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRAFP15056 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRAFP15056 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRAFP15056 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms