Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF40O75150 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF40O75150 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF40O75150 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF40O75150 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF40O75150 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF40O75150 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF40O75150 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF40O75150 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF40O75150 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF40O75150 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF40O75150 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF40O75150 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF40O75150 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF40O75150 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF40O75150 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF40O75150 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF40O75150 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF40O75150 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF40O75150 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF40O75150 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF40O75150 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF40O75150 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF40O75150 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF40O75150 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF40O75150 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF40O75150 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF40O75150 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF40O75150 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF40O75150 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF40O75150 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF40O75150 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF40O75150 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF40O75150 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF40O75150 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF40O75150 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF40O75150 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF40O75150 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF40O75150 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF40O75150 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF40O75150 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF40O75150 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF40O75150 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF40O75150 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF40O75150 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF40O75150 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF40O75150 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF40O75150 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF40O75150 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF40O75150 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF40O75150 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF40O75150 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF40O75150 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF40O75150 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF40O75150 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF40O75150 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF40O75150 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF40O75150 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF40O75150 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF40O75150 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF40O75150 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF40O75150 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF40O75150 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF40O75150 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF40O75150 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF40O75150 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF40O75150 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF40O75150 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF40O75150 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF40O75150 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF40O75150 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF40O75150 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF40O75150 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF40O75150 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF40O75150 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF40O75150 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF40O75150 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF40O75150 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF40O75150 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF40O75150 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF40O75150 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF40O75150 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF40O75150 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF40O75150 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF40O75150 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF40O75150 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF40O75150 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF40O75150 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF40O75150 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF40O75150 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF40O75150 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF40O75150 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF40O75150 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF40O75150 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF40O75150 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF40O75150 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF40O75150 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF40O75150 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF40O75150 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF40O75150 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms