Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
O00370 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
O00370 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
O00370 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
O00370 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
O00370 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
O00370 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
O00370 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
O00370 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
O00370 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
O00370 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
O00370 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
O00370 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
O00370 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
O00370 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
O00370 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
O00370 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
O00370 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
O00370 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
O00370 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
O00370 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
O00370 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
O00370 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
O00370 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
O00370 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
O00370 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
O00370 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
O00370 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
O00370 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
O00370 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
O00370 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
O00370 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
O00370 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
O00370 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
O00370 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
O00370 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
O00370 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
O00370 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
O00370 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
O00370 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
O00370 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
O00370 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
O00370 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
O00370 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
O00370 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
O00370 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
O00370 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
O00370 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
O00370 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
O00370 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
O00370 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
O00370 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
O00370 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
O00370 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
O00370 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
O00370 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
O00370 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
O00370 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
O00370 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
O00370 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
O00370 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
O00370 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
O00370 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
O00370 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
O00370 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
O00370 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
O00370 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
O00370 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
O00370 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
O00370 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
O00370 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
O00370 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
O00370 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
O00370 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
O00370 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
O00370 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
O00370 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
O00370 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
O00370 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
O00370 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
O00370 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
O00370 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
O00370 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
O00370 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
O00370 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
O00370 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
O00370 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
O00370 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
O00370 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
O00370 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
O00370 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
O00370 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
O00370 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
O00370 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
O00370 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
O00370 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
O00370 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
O00370 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
O00370 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
O00370 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms